测序数据分析(RNA-seq)流程
仪器编号
NCPSB40027
规格
生产厂家
国家蛋白质科学中心（北京）
型号
自研流程 V1
制造国家
分类号
放置地点
凤凰中心A408
出厂日期
2023-01-01
购置日期
1970-01-01
入网日期
2023-03-14
主要规格及技术指标
生信平台构建了对bulk RNA-seq及scRNA-seq技术获得的转录组数据的分析流程。基于原始测序数据FASTQ文件开始全流程分析，实现数据质控/去接头→数据比对→数据定量→计算差异→火山图/热图绘制→数据解读→归一化详解→FPKM/TPM/TMM计算。尤其对于scRNA-seq数据，流程具备快速分析（批次校正）、细胞亚群自动注释能力。
主要功能及特色
1. 采用学术领域广泛认可的分析方法完成分析
2. 凭借生物信息平台高性能计算环境保证数据分析进度；
3. 提供详细的分析参数及结果可视化报告
主要附件及配置
无
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