IPA(Ingenuity Pathway Analysis,通路分析软件)是一款基于云计算的图形化界面生物信息学软件,能够从生物学通路角度对组学数据进行分析、整合,帮助挖掘组学数据中的生物学机制,获取重要的生物标志物或药物靶标。
可用于分析无标及有标定量蛋白质组数据;核酸芯片及高通量测序仪定量的基因组、转录组数据;靶向及非靶向代谢组数据。
1、功能全面:IPA可以完成的分析项目包括表型、疾病、通路、分子主题文献查询;基因、蛋白质、代谢物、药物等分子的相互作用网络构建;疾病、功能富集分析,生物学下游效应分析;经典通路富集分析,通路活化效应分析;转录因子分析,转录调控分析;相互作用网络分析;生物标志物筛选分析;多实验条件(批次)数据比较分析。
2、数据准确、更新及时:IPA分析所用知识库基于其上百名具有生物医学领域知识的博士每天人工阅读整理的文献信息,该数据库自1998年起开始构建,着重收集生命科学、医学各领域权威杂志全文中的证据。保证了其所依据的注释信息高可信度高且及时更新。
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